本書の目的は、理論計算や三次元的な映像化と操作が、単に分子を眺めその美しい写真を撮るだけではなく、薬物作用のような分子的相互作用に対し新しいアイデアと信頼に足る作業仮説を得るために、実際に活用できることを示すことにある。