・歴史的に日本列島に居住してきた人類集団「ヤポネシア人」の起源と発展の歴史を、遺伝学・考古学・言語学などの文理融合研究によって紐解くシリーズ書。 ・第1巻では現代のヤポネシア人を遺伝学の観点から解説。 ・参照：第2巻『ヤポネシアの古代人ゲノム』、第3巻『ヤポネシアの動植物ゲノム』、第4巻『ヤポネシア人の考古と言語』 【主な目次】 第1部　現代ヤポネシア人ゲノムの全体像 1.　「内なる二重構造」モデルの検証 2.　二重構造モデルの検証 3.　ヤポネシア人ゲノムの多様性 4.　ヤポネシア人のY染色体多様性 5.　ゲノム規模SNPデータで探る地域性 第2部　現代ヤポネシア人ゲノムから見た地域多様性 6.　東アジア人のゲノム構造 7.　九州ヤマト人のゲノム 8.　先史琉球とゲノム研究 9.　宮古諸島人のゲノム解析 第3部　ゲノムと形質との関連 10. ヤポネシア人の寒冷適応能力 11. SNP以外のゲノム変化 12. ピロリ菌のゲノム解析 第1部　現代ヤポネシア人ゲノムの全体像 1.　「内なる二重構造」モデルの検証 2.　二重構造モデルの検証 3.　ヤポネシア人ゲノムの多様性 4.　ヤポネシア人のY染色体多様性 5.　ゲノム規模SNPデータで探る地域性 第2部　現代ヤポネシア人ゲノムから見た地域多様性 6.　東アジア人のゲノム構造 7.　九州ヤマト人のゲノム 8.　先史琉球とゲノム研究 9.　宮古諸島人のゲノム解析 第3部　ゲノムと形質との関連 10. ヤポネシア人の寒冷適応能力 11. SNP以外のゲノム変化 12. ピロリ菌のゲノム解析