利気の力に導かれ、またもや再会するサザンとティマたち。折りしも伝説の利学都市ドゥカイズが全世界に向けて侵略の魔の手を伸ばそうとしていた。利学を応用した超兵器で武装するドゥカイズ兵団に立ち向かうサザンたち。パドリアスの利学騎士セシリアも合流し、利力の源である「フェイト」を停止させるべく、都市中枢に突入した。