“第二次調査隊”としてガラパゴス諸島に上陸した、内気な青年・鉢植萼。彼の目的は、弱気な自分を変えるため、そして先に調査隊としてガラパゴス諸島へ向かった親友を捜すため。しかし、「生物の楽園」と呼ばれたその島で、調査隊を待ち受けていたのは、未知な進化をした動物達だった──。