海賊を名乗るクロスボーン・バンガードは、逆賊として連邦軍に包囲されてしまう。木星帝国に属するかつての仲間・ザビーネとの戦いも激化する中、新MSクロスボーン・ガンダムX3に乗り、トビアが戦場に飛び出す！