平凡な高校生、隼人には重大な秘密があった。彼が実は変身ヒーローであることを、知る者はない。全長２メートルの人型宇宙戦艦となった隼人は、宇宙の脅威・メガナイクスと戦いを繰り広げているのだ。しかし戦艦人間の存在をかぎつけたオカルト雑誌のライターが、隼人の周囲をかぎまわっている。そんな時、高校に現れた敵が生徒たちを襲った。教室に閉じ込められた友と幼なじみを、隼人は守り抜けるのか。