擬態人ハト派10万人が地球に来訪して数か月。実験都市・箱庭では、優悟から同期を受けた10万人が人間の目を盗みながら共存生活を送っていた。だが高度な知性と合理性を持つ擬態人にとって、感情的な人間社会に溶け込むことは難しく、様々なトラブルが発生していた。そんな中、同化エリートとして優悟の高校に通学する能瀬や乾や八十は、それぞれの体験を通じて＜人間の特権＞を探求するが…!? 一方で共存生活を管理する運営サイドのMIBに新たなる勢力が潜入。地球人と擬態人の離間を企てて…!?