ついに「神殺し」を決意した阿九斗は騎竜ピーターハウゼンに跨りコンスタン魔術学院の空に舞った。物語の鍵を握るけーな、阿九斗と敵対することになってしまった絢子、阿九斗に忠誠を誓う不二子、勇者ブレイブ、それぞれの運命は？戦場と化した学院を舞台に様々な思いや陰謀が交錯する。圧巻の魔王覚醒編後編。