・腸内細菌（腸内フローラ）は、免疫によって認識・排除されることなく、むしろ健康維持に極めて重要な役割があり、腸管上皮細胞や腸管粘膜固有層に存在する免疫細胞、さらには遠隔組織の機能を制御する細菌も存在する。長年不明だった実態が、次世代シークエンサーの開発や培養技術の革新により明らかになってきた。 ・共生する腸内細菌（腸内フローラ）のバランスが異常になると、さまざまな疾患の発症につながり、また、その病態と深く関わっていることも明らかになってきている。 ・本特集では、基礎研究分野の最先端、臨床医学分野における治療応用の最前線を紹介する。 ■腸内フローラの研究進展と臨床応用 ・はじめに ●基礎研究の進展 ・口腸臓器連関から紐解く炎症性腸疾患ーー口腔細菌の腸管定着戦略 〔key word〕臓器連関、炎症性腸疾患（IBD）、歯周炎、口腔細菌、異所粘膜定着戦略 ・腸脳相関における腸内細菌の役割 〔key word〕腸脳相関、迷走神経、腸内細菌 ・腸肝軸を介した腸内細菌関連因子が関わる肝臓のホメオスタシスと病態 〔key word〕腸肝軸、腸内細菌代謝物、組織微小環境 ・短鎖脂肪酸と腸内細菌叢 〔key word〕酢酸、プロピオン酸、酪酸、メタボローム解析 ・上皮バリアと腸内細菌 〔key word〕腸内細菌、上皮バリア、腸管免疫システム ・バクテリオファージと腸内細菌 〔key word〕バクテリオファージ、腸内共生病原菌、ファージ療法、エンドライシン ・マイクロバイオームによる消化管感染の制御 〔key word〕腸内細菌、病原細菌、消化管感染、定着抵抗性（CR）、マイクロバイオーム ・代謝性疾患と腸内細菌 〔key word〕腸内細菌代謝産物、肥満、糖尿病、腸内細菌叢 ・プロバイオティクス研究の最新動向 〔key word〕プロバイオティクス、プレバイオティクス、次世代プロバイオティクス、生菌製剤（LBPs） ・IgA抗体と腸内フローラーー有用菌/病因菌識別と臨床応用 〔key word〕分泌型IgA抗体、有用菌、病因菌、poly-reactivity、経口抗体医薬 ・腸内細菌由来代謝物の機能 〔key word〕腸内細菌、短鎖脂肪酸（SCFA）、トリプトファン代謝物（Trp）、ポリアミン、胆汁酸 ●治療への応用 ・循環器疾患と腸内細菌叢ならびに腸内細菌関連代謝物 〔key word〕動脈硬化、エンテロタイプ、バクテロイデス門菌、心不全、トリメチルアミンーN-オキシド（TMAO）、フェニルアセチルグルタミン（PAGln） ・新しいステージに入った多発性硬化症の細菌叢研究 〔key word〕多発性硬化症（MS）、腸内細菌叢、メタゲノム解析、ロングリード解析、二次進行型MS（SPMS） ・過敏性腸症候群と腸内細菌 〔key word〕過敏性腸症候群（IBS）、脳腸相関、腸内細菌、介入研究 ・生活習慣病と腸内細菌ーー予防と治療の展望 〔key word〕生活習慣病、腸内細菌叢、フレイル、胆汁酸（BA） ・炎症性腸疾患に関係する腸内細菌についての知見 〔key word〕炎症性腸疾患（IBD）、腸内細菌、糞便移植、プレバイオティクス、プロバイオティクス ・実装化に向けた腸内細菌叢移植療法の現状と展開 〔key word〕腸内細菌叢移植療法（FMT）、抗菌薬併用FMT（A-FMT）、潰瘍性大腸炎（UC）、Clostridioides difficile感染症（CDI）、マイクロバイオーム創薬 本雑誌「医学のあゆみ」は、最新の医学情報を基礎・臨床の両面から幅広い視点で紹介する医学総合雑誌のパイオニア。わが国最大の情報量を誇る国内唯一の週刊医学専門学術誌、第一線の臨床医・研究者による企画・執筆により、常に時代を先取りした話題をいち早く提供し、他の医学ジャーナルの一次情報源ともなっている。