米空母ホーネットを撃沈、エンタープライズを中破して史上初の空母対決に勝利した南太平洋海戦だったが、日本軍の被害も甚大で、ベテラン搭乗員が多数戦死、鑑載機が激減するなど深刻な状況だった。新長官に小沢中将を迎えて立て直しをはかる母艦航空隊。戦雲渦巻く海域へと出撃する空母瑞鶴の新たな戦いがはじまる。