魔法が使えないために、国から虐げられていた少女、エミリア。祖国を捨て、隣国に移住した彼女は、教会で聖女見習いとして働くことになる。その働きが聖女様に評価され、ついに幸せな日々が訪れる。そう思った矢先、お友達の妖精、ポッドが忽然と姿を消してしまう。途方に暮れるエミリアの前に、神の使いの空飛ぶユニコーンが現れる！　そして始まった、ポッド追跡の空の旅。その末に彼女がたどり着いたのは、神の力によって滅びゆく祖国でーー