4年ぶりの改訂となる2013年版では，急性中耳炎に関連する起炎菌や難治化などの病態の変化，予防を含めた治療法の発展など，多岐に亘る要因を考慮し，改訂を行った。具体的には，起炎菌サーベイランスデータの更新，重症度判定基準・治療アルゴリズムの見直しを行い，さらに肺炎球菌迅速検査キット，肺炎球菌ワクチン，新たな推奨薬剤や漢方補剤による診療，遷延性・難治性中耳炎等に関して，最新のデータに基づいて記述を修正，加筆した。