新しい物理理論である、超自然力（ＳＮＰ）理論が登場し、かつて魔力や超能力と言われていた力の存在が確認された世界。ＳＮＰの能力を持つ生徒たちが集まる神通学園に通うことになった牧野越也は、同じ能力を持つリーヤ、メイドのクリス、霜野千恵理らと共に、時にドタバタ、時にラブコメ、時にはバトル！？な学園生活を送ることになる。