第２版では、規格の改訂に伴い全面的に書き改めた。併せて、２００２年１０月に発行されたマネジメントシステム監査のガイド規格ＩＳＯ１９０１１：２００２（ＪＩＳＱ１９０１１：２００３）の内容も反映させた。実用に資するよう、システム構築段階及び改善段階の２つの内部監査チェックリストを収録した。