かつて水産庁に収蔵され、現在国立研究開発法人水産研究・教育機構中央水産研究所が所蔵し、総合地球環境学研究所が写真を所持する『免許漁業原簿』および『漁場図』の情報を核として、日本漁業の基層と系譜とその多様性について論ずる大著の研究篇（上・下巻）と、精細なる大型影印版により『漁場図』の重要な部分を紹介する資料篇（下巻）によって構成。 ー 上巻「漁業系譜論」 目次 - 漁業系譜論 序　章『免許漁業原簿』と日本の漁業系譜 第1章　日本のアユ漁業 第2章　日本のサケ・マス漁業 第3章　日本のウナギ漁業 第4章　干潟の漁業と生物 第5章　列島の海藻（草）漁業 第6章　玄界灘・東シナ海のアワビ漁業 第7章　瀬戸内海のタイ漁業 第8章　日本海のトビウオ漁 終　章　日本における漁業の系譜 ー 下巻「漁業の地域多様性・資料篇」 目次 - 漁業の地域多様性 序　章　日本の漁業と多様性 第1章　北方四島の漁業 第2章　伊豆諸島・小笠原諸島・硫黄列島の漁業 第3章　琉球列島の漁業 第4章　日本海・小離島の漁業 第5章　東京湾の漁業 第6章　駿河湾の漁業 第7章　富山湾の漁業 第8章　陸奥湾・三河湾・大村湾・錦江湾の漁業 終　章　日本における漁業多様性 資料篇 表一覧 専用漁業漁場図一覧 A 北方四島・北海道・東北　B 関東・伊豆・小笠原・硫黄　C 東海　D 越後・越中・越前　E 近畿　F 中国・四国　G 九州　H 琉球列島 ー 上巻「漁業系譜論」 目次 - 漁業系譜論 序　章『免許漁業原簿』と日本の漁業系譜 第1章　日本のアユ漁業 第2章　日本のサケ・マス漁業 第3章　日本のウナギ漁業 第4章　干潟の漁業と生物 第5章　列島の海藻（草）漁業 第6章　玄界灘・東シナ海のアワビ漁業 第7章　瀬戸内海のタイ漁業 第8章　日本海のトビウオ漁 終　章　日本における漁業の系譜 ー 下巻「漁業の地域多様性・資料篇」 目次 - 漁業の地域多様性 序　章　日本の漁業と多様性 第1章　北方四島の漁業 第2章　伊豆諸島・小笠原諸島・硫黄列島の漁業 第3章　琉球列島の漁業 第4章　日本海・小離島の漁業 第5章　東京湾の漁業 第6章　駿河湾の漁業 第7章　富山湾の漁業 第8章　陸奥湾・三河湾・大村湾・錦江湾の漁業 終　章　日本における漁業多様性 資料篇 表一覧 専用漁業漁場図一覧 A 北方四島・北海道・東北　B 関東・伊豆・小笠原・硫黄　C 東海　D 越後・越中・越前　E 近畿　F 中国・四国　G 九州　H 琉球列島