神谷平蔵は、神田の裏店に看板をあげる町医者。だがその実体は、悪には強いが情けにもろい凄腕の剣客である。 ある日、両国広小路で家宝の差し料を売ろうとしていた牢人・井関十郎太と出会った平蔵。 だがその刀が「妖刀」村正だったことから、成り行きは妙な方向へと動き始めた。 井関たちに持ちかけられた怪しい仕官話。村正を狙う謎の剣客。 そしてついには井関自身が闇討ちされて手傷を負い、仲間の一人も凶刃に斃れてしまう。 同心・斧田晋吾とともに探索に乗り出した平蔵だが、事件の背後には思いも寄らぬ政商癒着のからくりが…。