毛利小五郎の危機一髪と謎の人物、本堂瑛佑、現れる。

▼第1話／ターゲットを追え！▼第2話／新たなる指令▼第3話／黒の組織VS.FBI（1）▼第4話／黒の組織VS.FBI（2）▼第5話／新しい先生▼第6話／秘密の通学路（1）▼第7話／秘密の通学路（2）▼第8話／戻れない二人▼第9話／密閉された車▼第10話／偽りの愛情▼特別付録／名探偵コナン完全キャラクターBOOK●主な登場人物／江戸川コナン（見かけは小学生だが、その正体は「黒の組織」に薬を飲まされ子供の姿になった高校生名探偵・工藤新一）、毛利蘭（帝丹高校に通う新一の幼なじみで、ガールフレンド）、毛利小五郎（蘭の父親。妻に逃げられ、娘の蘭と二人暮らしのヘボ探偵だったが、コナンのおかげで世間からは名探偵だと思われている）●あらすじ／黒の組織の一員であることが発覚したアナウンサー・水無怜奈。彼女に仕込んだ盗聴器から、衆議院議員候補者の暗殺計画を察知したコナンだったが、狙撃場所を示す暗号「エディP」がなかなか解けない。暗殺時刻まで30分を切ったとき、"狩り場""二重人格"などのキーワードからコナンが謎解きした場所とは…!?（第1話）●本巻の特徴／危機一髪のところで暗殺を阻んだコナンだったが、黒の組織は暗殺場所を変更。しかも、コナンが仕掛けた盗聴器に気付かれてしまい、組織は毛利小五郎のもとへ…!?（第1〜4話） その他、行方不明になった少女の捜索をめぐる少年探偵団の活躍（第5〜7話）、蘭のクラスの転校生・本堂瑛祐が毛利探偵事務所を訪れたときに起きた事件（第8〜10話）を収録。●その他の登場人物／灰原哀（新一を幼児化させた薬の考案者だが、自らも幼児化して「黒の組織」から逃亡。現在、コナンの同級生として阿笠の家に居候中）、小嶋元太・吉田歩美・円谷光彦（コナンの同級生。コナン、哀と共に少年探偵団を結成）、水無怜奈（イタズラに悩み小五郎に捜査を依頼した人気アナウンサー。実は黒の組織に関係している）、ジョディ・スターリング（帝丹高校の英語教師として来日したFBIメンバー）